NanoLabo Tool同梱計算エンジン

Windows版

NanoLabo Toolインストール先の exec.WIN にQuantum ESPRESSO( qe )、LAMMPS、MPIの実行ファイルがあります。

実行ファイルのパスを環境変数 Path に設定していただくと便利です。一時的に追加するには、以下を実行してください。

デフォルトの場所にインストールした場合の例

set Path=C:\Program Files\AdvanceSoft\NanoLabo\exec.WIN\qe;C:\Program Files\AdvanceSoft\NanoLabo\exec.WIN\lammps;C:\Program Files\AdvanceSoft\NanoLabo\exec.WIN\mpi;%Path%

また、永続的に追加するには、システムのプロパティから環境変数 Path を編集してください。

Quantum ESPRESSOでDFT計算(SCF計算)を実行するには、 pw.exe に入力ファイルを渡して実行します。

入力ファイル PW.inp の実行例

pw.exe -in PW.inp 1> PW.out 2> PW.err

並列実行例

mpiexec.exe -n 4 pw.exe -in PW.inp 1> PW.out 2> PW.err

LAMMPSで分子動力学計算を実行するには、 lammps.exe に入力ファイルを渡して実行します。

入力ファイル lammps.in の実行例

lammps.exe < lammps.in 1> lammps.out 2> lammps.err

並列実行例

mpiexec.exe -n 4 lammps.exe < lammps.in 1> lammps.out 2> lammps.err

Linux版

NanoLabo Toolインストール先の exec.LINUX にQuantum ESPRESSO( qe_parallel )、LAMMPS( lammps_parallel )、MPIの実行ファイルがあります。

実行時には mpi/lib にある動的ライブラリが必要ですので、環境変数 LD_LIBRARY_PATH に設定するため、以下を実行してください。

デフォルトの場所にインストールした場合の例

export LD_LIBRARY_PATH=/opt/AdvanceSoft/NeuralMD/exec.LINUX/mpi/lib:$LD_LIBRARY_PATH

また、実行ファイルのパスを環境変数 PATH に設定していただくと便利です。

デフォルトの場所にインストールした場合の例

export PATH=/opt/AdvanceSoft/NeuralMD/exec.LINUX/qe_parallel:/opt/AdvanceSoft/NeuralMD/exec.LINUX/lammps_parallel:/opt/AdvanceSoft/NeuralMD/exec.LINUX/mpi/bin:$PATH

Quantum ESPRESSOでDFT計算(SCF計算)を実行するには、 pw.x に入力ファイルを渡して実行します。

入力ファイル PW.inp の実行例

pw.x -in PW.inp 1> PW.out 2> PW.err

並列実行例

mpirun -n 4 pw.x -in PW.inp 1> PW.out 2> PW.err

LAMMPSで分子動力学計算を実行するには、 lammps に入力ファイルを渡して実行します。

入力ファイル lammps.in の実行例

lammps < lammps.in 1> lammps.out 2> lammps.err

並列実行例

mpirun -n 4 lammps < lammps.in 1> lammps.out 2> lammps.err